工程中心现有同位素质谱仪、气相色谱/质谱联用仪、气相色谱仪、高效液相色谱仪、原子吸收分光光度计、稳态瞬态荧光光谱仪、化学吸附仪、分子蒸馏设备、触角电位测试系统、超临界CO₂萃取装置、实验室型植物精油萃取机组、全自动智能化学分析仪、生物显微镜、微波消解仪、冷冻切片机、总有机碳分析仪液体/固体全自动进样器、昆虫室内行为分析系统、CO₂临界点干燥仪、凝胶成像分析系统、核酸蛋白测定仪等仪器设备，总值达2267万元。